根據財稅2011100號文的規定，軟件企業增值稅的即征即退是指增值稅一般納稅人銷售軟件產品的對其增值稅實際稅負超過3%的部分實行即征即退政策。而非獨立核算的分公司只有滿足是增值稅一般納稅人的情況下，銷售軟件產品，并且取得省級軟件產業主管部門認可的軟件檢測機構出具的檢測證明材料;軟件產業主管部門頒發的《軟件產品登記證書》或著作權行政管理部門頒發的《計算機軟件著作權登記證書》等條件后，才可以享受軟件企業增值稅的即征即退。

　　綜上，分公司是否獨立核算不影響增值稅即征即退政策的享受，而是看分公司是否屬于增值稅

　　一般納稅人，是否能夠符合軟件產品的資料等條件。

　　補充說明：分公司是否獨立核算更多影響的是企業所得稅征管。

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　　相關規定：

　　《財政部國家稅務總局關于軟件產品增值稅政策的通知》（財稅2011100號）

　　一、軟件產品增值稅政策

　　(一)增值稅一般納稅人銷售其自行開發生產的軟件產品，按17%稅率征收增值稅后，對其增值稅實際稅負超過3%的部分實行即征即退政策。

　　(二)增值稅一般納稅人將進口軟件產品進行本地化改造后對外銷售，其銷售的軟件產品可享受本條第一款規定的增值稅即征即退政策。

　　本地化改造是指對進口軟件產品進行重新設計、改進、轉換等，單純對進口軟件產品進行漢字化處理不包括在內。

　　(三)納稅人受托開發軟件產品，著作權屬于受托方的征收增值稅，著作權屬于委托方或屬于雙方共同擁有的不征收增值稅;對經過國家版權局注冊登記，納稅人在銷售時一并轉讓著作權、所有權的，不征收增值稅。

　　二、軟件產品界定及分類

　　本通知所稱軟件產品，是指信息處理程序及相關文檔和數據。軟件產品包括計算機軟件產品、信息系統和嵌入式軟件產品。嵌入式軟件產品是指嵌入在計算機硬件、機器設備中并隨其一并銷售，構成計算機硬件、機器設備組成部分的軟件產品。

　　三、滿足下列條件的軟件產品，經主管稅務機關審核批準，可以享受本通知規定的增值稅政策：

　　1.取得省級軟件產業主管部門認可的軟件檢測機構出具的檢測證明材料;

　　2.取得軟件產業主管部門頒發的《軟件產品登記證書》或著作權行政管理部門頒發的《計算機軟件著作權登記證書》。