事業單位取得收入應當辦理稅務登記，收到個稅手續費返還后要繳納增值稅。

根據國家稅務總局 12366 納稅服務平臺 2017 年 01 月 17 日答疑，是“按照目前營改增政策相關規定，納稅人代扣代繳個人所得稅取得的手續費收入應屬于增值稅征稅范圍，應繳納增值稅。”根據國稅發200637 號文的規定，除國家機關、個人(自然人)和無固定生產、經營場所的流動性農村小商販外，納稅人都應當申報辦理稅務登記。國家機關所屬事業單位有經營行為、取得應稅收入、財產、所得的，也應當辦理稅務登記。

需提醒的是，如果登記為小規模納稅人，則可以享受小規模納稅人增值稅稅收優惠的政策。

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相關規定：

《國家稅務總局關于完善稅務登記管理若干問題的通知》(國稅發200637 號)

一、 稅務登記的范圍及管理

按照稅收征管法及其實施細則和稅務登記管理辦法的有關規定，除國家機關、個人(自然人)和無固定生產、經營場所的流動性農村小商販外，納稅人都應當申報辦理稅務登記。國家機關所屬事業單位有經營行為、取得應稅收入、財產、所得的，也應當辦理稅務登記。

稅務登記實行屬地管理，納稅人應當到生產、經營所在地或者納稅義務發生地的主管稅務機關申報辦理稅務登記。非獨立核算的分支機構也應當按照規定分別向生產經營所在地稅務機關辦理稅務登記。