1.企業(yè)是否按規(guī)定要求設置研發(fā)費用輔助核算賬目，是否按規(guī)定分項歸集并填寫《企業(yè)年度研究開發(fā)費用結構明細表》。

2.雖然企業(yè)提交的資料已經包含了中介機構出具的研發(fā)費用專項審計報告，但在現場檢查時，也會看企業(yè)的研發(fā)費用明細賬。如果企業(yè)在會計科目中未設置“研發(fā)支出”、“管理費用――研發(fā)費用”等科目，就無法證明報送的研發(fā)費用屬于研發(fā)中產生的研發(fā)費用。研發(fā)費用不達標，申請高新必然會被否決。

3.企業(yè)未能按照國家財務會計制度要求設置研發(fā)支出科目，或雖然設置了科目但研究開發(fā)費用計入了生產成本，通過原始憑證判斷研發(fā)費用歸集的合理性,對于無法區(qū)分且原始憑證不具有證明力的部分，應調減研究開發(fā)費用歸集金額重新計算企業(yè)研究開發(fā)費用占比指標，判斷其是否符合高新技術企業(yè)認定條件。