一、增值稅方面，債券屬于金融商品范疇，根據《財政部 國家稅務總局關于全面推開營業稅改征增值稅試點的通知》(財稅〔2016〕36號)附件1所附《銷售服務、無形資產、不動產注釋》規定，“金融商品持有期間(含到期)利息(保本收益、報酬、資金占用費、補償金等)收入”屬于“金融服務”中的“貸款服務”。因此，納稅人持有債券這一金融商品取得的利息收入，屬于增值稅征稅范圍。在征稅范圍內，政策規定明確免征的，可享受免稅待遇;未明確規定免征的，則應繳納增值稅。那么，免稅范圍究竟有哪些?36號文件附件3規定，國債和地方政府債利息收入免征增值稅。隨后，《財政部 國家稅務總局關于進一步明確全面推開營改增試點金融業有關政策的通知》(財稅〔2016〕46號)和《財政部 國家稅務總局關于金融機構同業往來等增值稅政策的補充通知》(財稅〔2016〕70號)先后發布，分別明確規定：持有政策性金融債券和非政策性金融債券取得的利息收入，屬于36號文件附件3所稱的“金融同業往來利息收入”，免征增值稅。

需要關注的是，國債和地方政府債利息收入免稅是針對所有納稅人的，任何單位和個人持有國債和地方政府債取得的利息收入，均免征增值稅;金融債券利息收入是作為“金融同業往來利息收入”免稅的，只有特定“金融機構”持有金融債券取得的利息收入，方可做免稅處理。特定的“金融機構”具體是指36號文件附件3第一條第(二十三)項所規定的范圍，具體包括銀行、信用合作社、證券公司、金融租賃公司、證券基金管理公司、財務公司、信托投資公司、證券投資基金、保險公司，以及其他經人民銀行、銀監會、證監會、保監會批準成立且經營金融保險業務的機構等。上述范圍以外的機構，因不屬于36號文件規定的“金融機構”，其持有金融債券取得的利息收入不屬于“金融同業往來利息收入”，無法享受免稅待遇。

除了國債、地方政府債和金融債券有免稅優惠政策外，對納稅人持有的鐵路債券以及各類企業債券的利息收入，無論是金融機構持有還是非金融機構持有，一律征收增值稅。

需要說明的是：企業購入國債、地方政府債、金融債券的利息收入免征增值稅是指持有至到期取得的利息收入，對持有未到期之前轉讓國債、地方政府債、金融債券和企業債券，其轉讓收入則不享受稅收優惠。財稅〔2016〕36號附件1的銷售服務、無形資產、不動產注釋規定，屬于金融商品轉讓，應按照賣出價扣除買入價后的余額為銷售額，按金融服務繳納增值稅：金融商品轉讓可以多種產品合并計算，以最后的收益負來確認是否繳納增值稅;不同金融商品轉讓的收益和虧損只能在一個年度內互抵，不得跨年抵減;金融商品轉讓，不得開具增值稅專用發票，應全額開具增值稅普通發票。個人金融商品轉讓免征增值稅。

二、企業所得稅方面，根據企業所得稅法規定，國債利息收入為企業所得稅免稅收入。《國家稅務總局關于企業國債投資業務企業所得稅處理問題的公告》(國家稅務總局公告2011年第36號)所稱國債利息收入，是指企業持有國務院財政部門發行的國債取得的利息收入。具體按以下規定執行：(1)企業從發行者直接投資購買的國債持有至到期，其從發行者取得的國債利息收入，全額免征企業所得稅。(2)企業到期前轉讓國債、或者從非發行者投資購買的國債，按規定計算的國債利息收入，免征企業所得稅。即：國債利息收入=國債金額×(適用年利率÷365)×持有天數。上述公式中的“國債金額”，按國債發行面值或發行價格確定;“適用年利率”按國債票面年利率或折合年收益率確定;如企業不同時間多次購買同一品種國債的，“持有天數”可按平均持有天數計算確定。也就是說，企業投資者國債持有期間應計利息收入享受免稅待遇，消除了企業投資者國債持有期間轉讓國債而取得的收入中，未到期兌付應計利息收入是否可視為免稅收入的爭議。

對于地方政府債券，根據《國家稅務總局關于地方政府債券利息免征所得稅問題的通知》(財稅〔2013〕5號)的規定，對企業取得的2012年及以后年度發行的地方政府債券利息收入，免征企業所得稅。2011年時，財政部、國家稅務總局就曾下發通知，明確對企業取得的2009年、2010年和2011年發行的地方政府債券利息所得，免征企業所得稅。這一次則將免稅的范圍擴大至2012年以及以后年度發行的地方政府債券。但企業到期前轉讓地方政府債券、或者從非發行者投資購買的地方政府債券是否可以參照國債，將應計利息收入作為免稅收入呢?法無明確規定，因此，對二級市場轉讓地方政府債券屬于財產轉讓所得或損失，應當并入企業所得稅應納稅所得額。

企業持有鐵路建設債券利息收入。根據《財政部 國家稅務總局關于鐵路建設債券利息收入企業所得稅政策的通知》(財稅〔2011〕99號)規定：對企業持有2011-2013年發行的中國鐵路建設債券取得的利息收入，減半征收企業所得稅。中國鐵路建設債券是指經國家發展改革委核準，以鐵道部為發行和償還主體的債券。根據《財政部 國家稅務總局關于20142015年鐵路建設債券利息收入企業所得稅政策的通知》(財稅〔2014〕2號)規定：對企業持有2014和2015年發行的中國鐵路建設債券取得的利息收入，減半征收企業所得稅。中國鐵路建設債券是指經國家發展改革委核準，以中國鐵路總公司為發行和償還主體的債券。根據《財政部 國家稅務總局關于鐵路債券利息收入所得稅政策問題的通知》(財稅〔2016〕30號)規定：對企業投資者持有2016-2018年發行的鐵路債券取得的利息收入，減半征收企業所得稅。鐵路債券是指以中國鐵路總公司為發行和償還主體的債券，包括中國鐵路建設債券、中期票據、短期融資券等債務融資工具。

對企業投資國債、地方政府債券鐵路債券以外的債券投資收益，均按規定計入企業所得稅收入。

三、個人所得稅方面，個人所得稅法第四條規定，國債利息和國家發行的金融債券利息免納個人所得稅。其中，國債利息是指個人持有我國財政部發行的債券而取得的利息所得，即國庫券利息;國家發行的金融債券利息是指個人持有經國務院批準發行的金融債券而取得的利息所得。另據財稅〔2013〕5號規定：對個人取得的2012年及以后年度發行的地方政府債券利息收入，免征個人所得稅。但對個人買賣國債或地方政府債券所得，應當要按財產轉讓所得計算繳納個人所得稅。對于一些經國務院有關部委批準，以企業債券形式籌集部分建設資金或經營性資金，如鐵道部發行的**建設債券，中國建設銀行和其他金融機構發行用于自身經營的債券以及企業依照程序發行的企業債券，均不屬于免稅債券范疇，因此，對個人投資企業債券沒有免稅照顧。

四、印花稅方面，政府發行債券如果征收印花稅，也只能是按“借款合同”稅目征收。根據《中人民共和國印花稅暫行條例》印花稅稅目稅率表的規定，借款合同是銀行及其它金融組織和借款人(不包括銀行同業拆借)所簽訂的借款合同，按借款金額萬分之零點五貼花。但是政府發行債券時，發行人與購買債券方實際上并不簽訂借款合同的，因此不屬于印花稅稅目稅率表中列舉的借款合同稅目，因此不需要繳納印花稅。