支付給供應商的賠償款取得專票能否抵扣進項？
答：根據增值稅暫行條例第六條以及實施細則第十二條，增值稅銷售額為納稅人銷售貨物或者應稅勞務向購買方收取的全部價款和價外費用，而向購買方收取的賠償金屬于價外費用。您的情況是運輸公司B提供服務，因為貴公司超期報關（貨代A造成），造成貨物滯留，B公司向貴公司收取賠償金，這部分金額符合上面法律規定的增值稅應稅價外費用。對于B公司來說，應該并入運輸服務銷售額，計算繳納增值稅，同時給您開具專用發票。您取得專用發票上的進項稅額可以抵扣。
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相關規定：
《中華人民共和國增值稅暫行條例（2017年修訂）》（中華人民共和國國務院令第691號）
第六條銷售額為納稅人銷售貨物或者應稅勞務向購買方收取的全部價款和價外費用，但是不包括收取的銷項稅額。
《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》
第十二條條例第六條第一款所稱價外費用，包括價外向購買方收取的手續費、補貼、基金、集資費、返還利潤、獎勵費、違約金、滯納金、延期付款利息、賠償金、代收款項、代墊款項、包裝費、包裝物租金、儲備費、優質費、運輸裝卸費以及其他各種性質的價外收費。
《中華人民共和國發票管理辦法（2010年修訂）》（中華人民共和國國務院令第587號）
第十九條，銷售商品、提供服務以及從事其他經營活動的單位和個人，對外發生經營業務收取款項，收款方應當向付款方開具發票。
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相關規定：
《中華人民共和國增值稅暫行條例（2017年修訂）》（中華人民共和國國務院令第691號）
第六條銷售額為納稅人銷售貨物或者應稅勞務向購買方收取的全部價款和價外費用，但是不包括收取的銷項稅額。
《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》
第十二條條例第六條第一款所稱價外費用，包括價外向購買方收取的手續費、補貼、基金、集資費、返還利潤、獎勵費、違約金、滯納金、延期付款利息、賠償金、代收款項、代墊款項、包裝費、包裝物租金、儲備費、優質費、運輸裝卸費以及其他各種性質的價外收費。
《中華人民共和國發票管理辦法（2010年修訂）》（中華人民共和國國務院令第587號）
第十九條，銷售商品、提供服務以及從事其他經營活動的單位和個人，對外發生經營業務收取款項，收款方應當向付款方開具發票。