很多人對零申報具有一定的誤解，但是實際上，很多情況下是不能零申報的，很有肯你就在不經意間做了違規零申報的處理。違規零申報和長期零申報都會產生不良后果。

1、長期零申報，納稅人就會被稅務機關納入重點監控范圍，然后按照相關規定進行評估。如果發現納稅人有隱瞞收入、虛開發票等違規行為，不僅會要求補齊當期稅款和滯納金，還會對其進行處罰，若情節嚴重，移送稽查。

2、發現納稅人是走逃戶，會把納稅人納入重大失信名單，同時對外公告。

相關部門會核查“售票方”，若查出其存在虛開增值稅發票、惡意串通等情況，要按規定進行懲罰，與此同時走逃戶納稅人被評為D納稅人，并承擔D納稅人的后果。

3、對于長期零申報且持有發票的納稅人，會對其發票采取降版降量措施。按照規定，還可以要求納稅人去稅務機關對發票的使用進行核查。

4、當稅務機關通過核查后，按照規定，可以用成本費用公示核定納稅人收入。

所以，零申報絕對不是企業解決問題可以長期采用的方法，只是暫時的。假如公司長期沒有應稅收入，或者長期虧損，應該考慮是否繼續經營，從而避免稅收風險和信用降級。

另外，若是進行零申報，必須按時記賬，按時填寫納稅申報單。