一、經營主體不同

一類醫療器械對經營主體這方面沒有實質的要求，也就是說即使是個體工商戶也是可以經營一類醫療器械的，而二類和三類醫療器械的經營主體則必須具有企業資質。

二、經營條件不同

雖然經營一類醫療器械不需要辦理經營許可和備案，但從事第一類醫療器械經營的還是應當符合以下要求：一是應當具有與經營規模和經營范圍相適應的經營場所和貯存條件。二是具有與經營的醫療器械相適應的質量管理制度和質量管理機構或者人員。三是應當按照醫療器械經營質量管理規范要求，建立覆蓋質量管理全過程的經營管理制度，保證經營條件和經營行為持續符合要求。

而經營二類、三類醫療器械的企業，除了需要滿足以上這些條件之外，還需要辦理二類醫療器械經營備案憑證和醫療器械經營許可證。

三、生產所需辦理證件不同

開辦一類醫療器械生產企業的，生產企業應當提交本企業持有的所生產醫療器械備案憑證復印件以及營業執照復印件、組織機構代碼證復印件、企業人員證明材料復印件、生產場地證明文件復印件、質量文件等備案材料，向所在地設區的市級食品藥品監督管理部門辦理第一類醫療器械生產備案。

而開辦二類、三類醫療器械生產企業的，則應當提交本企業持有的所生產醫療器械注冊證復印件及營業執照復印件、企業人員證明材料復印件、生產場地證明文件復印件等材料，向所在地省、自治區、直轄市食品藥品監督管理部門申請醫療器械生產許可。

四、委托生產所需辦理手續不同

企業委托生產第一類醫療器械的，委托方應當向所在地設區的市級食品藥品監督管理部門辦理委托生產備案。符合規定條件的，食品藥品監督管理部門會發給企業醫療器械委托生產備案憑證。

而委托生產第二類、第三類醫療器械的，委托方則應當向所在地省、自治區、直轄市食品藥品監督管理部門辦理委托生產備案。