應該說，稅法明確規定了企業購進農產品的如何抵扣進項稅。其購進農產品進項稅的計算方法，具體包括如下幾個方面：

一是企業購進的農產品，取得的是一般納稅人開具的增值稅專用發票或海關進口專用繳款書的，那么以增值稅專用發票或海關進口增值稅專用繳款書上注明的增值稅稅額為進項稅額，在計算增值稅時可以抵扣。

二是企業購進的農產品，是從簡易計稅法依照3%征收率計算繳納增值稅的小規模納稅人，取得的增值稅專用發票的，在計算進項稅時，不是按照3%的征收率計算扣除率，而是按照增值稅專用發票上注明的采購金額和9%的扣除率計算進項稅額。

三是企業購進的農產品，取得或自行開具農產品銷售發票或收購發票的，以農產品銷售發票或收購發票上注明的農產品買價和9%的扣除率計算進項稅額?，F實時，自行開具農產品收購發票的企業也很多，比如生豬屠宰企業，收購的毛豬，均是企業自行開具的農產品收購發票。稅務機關對自行開具的農產品收購發票的管理也很嚴格。

四是企業購進的農產品，用于生產銷售或委托加工執行增值稅13%稅率貨物的農產品，按照10%的扣除率計算進項稅額。企業購進農產品進項稅額的計算公式：進項稅額=買價*適用的扣除率。

五是企業購進的農產品，用于企業混合銷售行為的，即用于生產銷售或委托受托加工13%稅率貨物又用于生產銷售其他貨物服務的，作為企業應當分別核算用于生產銷售或委托受托13%稅率貨物和其他貨物服務的農產品進項稅額。

而如果企業沒有分別核算的，則需要統一以增值稅專用發票或海關進口增值稅專用繳款書上注明的增值稅額為進項稅額，或以農產品收購發票或銷售發票上注明的農產品買價和9%的扣除率計算進項稅額。

六是對煙葉稅企業按規定繳納的煙葉稅，準予并入煙葉產品的買價計算增值稅的進行稅額，并在計算繳納增值稅時予以抵扣。購進煙葉準予抵扣的增值稅進項稅額，按照收購煙葉實際支付的價款總額和煙葉稅及法定扣除率計算。計算公式為，煙葉稅應納稅額=收購煙葉實際支付的價款總額*稅率（20%），準予抵扣的進項稅額=（收購煙葉實際支付的價款總額+煙葉稅應納稅額）*扣除率。

另外，企業從批發、零售環節購進適用免征增值稅政策的蔬菜、部分鮮活肉蛋而取得的普通發票，不得作為計算抵扣進項稅額的憑證。

在此需要說明的是，自2017年7月1日起，以購進農產品為原料生產銷售液體乳及乳制品、酒及酒精、植物油的增值稅一般納稅人，可以納入農產品增值稅進項稅額核定扣除試點范圍，其購進農產品無論是否用于列入試點生產的產品，增值稅進項稅額均按照《農產品增值稅進項稅額核定辦法》的規定抵扣。其核定方法主要包括投入產出法、成本法和參照法。