1. 提高資金使用效果和行政效率

行政事業單位的資金使用不像企業追求利益最大化，而是要求資金達到相應的績效目標，規范資金撥付流程,優化行政辦事程序, 構建完善的內部控制體系，保證資金安全的同時，也優化提高財政性資金的使用效果，將資金效益最大化。規范的資金使用流程還可以提高行政事務辦結效率和促進行政職能發揮。

2. 防范單位內部風險，促進廉政建設

完善的內部控制可以有效降低單位開展業務工作過程中的各方面風險，規范各項工作的業務流程，保障經濟活動處于合法合規基本原則之下，封堵住了大部分行政體制上漏洞,從經濟活動開展的整個過程中減少了腐敗發生的可能性，促進了單位的廉政建設，也從一側面也保護了工作人員。

3. 有效節約行政成本

完善的內部控制制度建設，規范了業務工作流程，最大程度上優化工作內容，避免了很多重復工作和多余內容。

4. 保障單位資產安全

行政事業單位的資產擁有管理的責任，資產也是公務人員發揮行政職能必要物質條件，通過建立完善的資產管理體系和機制，可以保證國有資產發揮應有的作用，防止國有資產流失。

5. 保障財務信息真實可靠