從上述規定可以看出，目前土地增值稅預繳計算方式有兩種。

一、第一種計算方式

預繳土地增值稅=不含增值稅收入*土地增值稅預征率

增值稅采用一般計稅方法：預收款/（1+9%）*土地增值稅預征率=0.9174預收款*土地增值稅預征率

需要注意的是，對于一般計稅的項目來說，不含增值稅收入如何理解是有爭議的。部分觀點認為，不含增值稅收入 =含增值稅收入 -銷項稅額 =含增值稅收入 –（含增值稅收入 -土地價款）/(1+9%)x9%。如按該方式計算土地增值稅預繳稅額的計算基數，計算土地增值稅預繳時需要考慮土地價款的分攤。

增值稅采用簡易計稅方法：預收款/（1+5%）*土地增值稅預征率=0.9524預收款*土地增值稅預征率

二、第二種計算方式

增值稅采用一般計稅方法：應預繳稅款=（預收款-預收款/（1+9%）*3%）*土地增值稅預征率=0.9724預收款*土地增值稅預征率

增值稅采用簡易計稅方法：（預收款-預收款/（1+5%）*3%））*土地增值稅預征率=0.9712預收款*土地增值稅預征率

三、應適用何種預繳計算方式？

國家層面的稅收規定允許選擇兩種方式預繳土地增值稅。從上述分析情況看，對于簡易計稅項目，方式二預繳稅款比方式一要高，因此選擇方式一更為有利；

對于一般計稅項目，方式一的計算方式有爭議，需要了解稅務執行口徑，才能判斷哪種方式更為有利。

四、要注意的問題