一是關于存量留抵稅額和增量留抵稅額。允許退還的留抵稅額，是以留抵稅額的余額為基礎進行計算的，留抵稅額包括增量留抵稅額和存量留抵稅額。

存量留抵稅額，是指留抵退稅制度實施前納稅人形成的留抵稅額。在確定存量留抵稅額時，以納稅人2019年3月底的期末留抵稅額為標準值。如果納稅人當期期末留抵稅額大于2019年3月底的期末留抵稅額，以2019年3月底數為存量留抵稅額。如果納稅人當期期末留抵稅額小于2019年3月底的期末留抵稅額，以納稅人當期的期末留抵稅額為存量留抵稅額。需要注意的是，一次性退還存量留抵稅額后，存量留抵稅額為零。

增量留抵稅額，是指留抵退稅制度實施后，即2019年4月1日以后納稅人新增加的留抵稅額。如前所述，如果納稅人當期的期末留抵稅額大于2019年3月底的期末留抵稅額，則增加部分即為增量留抵稅額。需要注意的是，一旦納稅人獲得存量留抵退稅后，不再需要與2019年3月底的期末留抵稅額進行比較，當期期末留抵稅額即為增量留抵稅額。

二是關于進項構成比例的規定。為簡化操作，減輕納稅人核算負擔，此次留抵退稅新政策不區分存量留抵退稅和增量留抵退稅，均設置統一的進項構成比例。同時，計算取數區間也與老政策相同，統一設置為2019年4月1日至申請退稅前。

需要說明的是，納入進項構成比例計算的扣稅憑證中，增加了帶有“增值稅專用發票”字樣全面數字化的電子發票和納入進項抵扣憑證范圍的收費公路通行費增值稅電子普通發票，作為進項構成比例計算公式的分子，且這一調整也同樣適用于繼續實施的老政策。