這個問題存在兩種觀點：

一種觀點認為：可以抵扣，企業發行債券支付給主承銷商的承銷費屬于稅法中的“直接收費金融服務費”，企業取得主承銷商開具的承銷費增值稅專用發票可以抵扣進項稅額。

另一種觀點認為：企業發行債券支付的包銷承銷費即便取得增值稅專用發票其進項稅額也不得從銷項稅額中抵扣，理由是“納稅人接受貸款服務向貸款方支付的與該筆貸款直接相關的投融資顧問費、手續費、咨詢費等費用，其進項稅額不得從銷項稅額中抵扣。”。

首先：可以確定的是，債券承銷費是發行債券過程中支付給主承銷商的服務費，屬于稅法中的“直接收費金融服務，是指為貨幣資金融通及其他金融業務提供相關服務并且收取費用的業務活動。包括提供貨幣兌換、賬戶管理、電子銀行、信用卡、信用證、財務擔保、資產管理、信托管理、基金管理、金融交易場所(平臺)管理、資金結算、資金清算、金融支付等服務。”

其次：常情況下主承銷商不會購買發行人所發行的債券，只有在承銷協議中約定余額包銷的情況下，才可能去購買發行人的部分債券。這樣的話確實存在稅法中規定的情形，即“納稅人(借款人或發行人)接受貸款服務向貸款方(主承銷方)支付的與該筆貸款直接相關的投融資顧問費、手續費、咨詢費等費用”。