新能源工程公司是指以新能源技術為主要業務的企業，如風能、太陽能、生物質能、地熱能、海洋能等。新能源工程公司的申請手續一般包括以下幾個方面：

首先，需要進行公司名稱的核準和登記。公司名稱應符合國家規定的格式，不能與已有的公司名稱重復或相近，也不能含有違法或違反社會公德的內容。公司名稱的核準和登記可以通過工商行政管理部門的網上服務平臺或者到工商行政管理機關辦理。

其次，需要辦理公司的營業執照

營業執照是公司的法人證書，是公司合法經營的基礎。辦理營業執照需要提交以下材料：

公司名稱預先核準通知書

公司章程

公司股東的身份證明和出資證明

公司法定代表人的身份證明和任職文件

公司住所的產權證明或租賃合同

其他相關的審批文件，如環保、安全、衛生等

提交材料后，工商行政管理部門會對公司的設立條件、經營范圍、注冊資本等進行審核，審核通過后，頒發營業執照。

再次，需要辦理公司的稅務登記

稅務登記是公司履行納稅義務的前提，也是享受稅收優惠政策的條件。辦理稅務登記需要提交以下材料：

營業執照副本

公司法定代表人的身份證明

公司財務負責人和會計的身份證明

公司的開戶許可證和銀行賬戶信息

公司的主要經營項目和預計年收入

其他相關的審批文件，如高新技術企業認定證書、新能源項目備案證明等

提交材料后，稅務部門會對公司的納稅人資格、納稅種類、征收方式等進行登記，登記完成后，頒發稅務登記證。

最后，需要辦理公司的社會保險登記

社會保險登記是公司為員工繳納社會保險的必要手續，也是保障員工權益的重要措施。辦理社會保險登記需要提交以下材料：

營業執照副本

公司法定代表人的身份證明

公司的組織機構代碼證

公司的社會保險登記申請表

公司的員工名單和身份證明

其他相關的審批文件，如工傷保險備案證明、醫療保險備案證明等

提交材料后，社會保險部門會對公司的參保人數、參保項目、繳費基數等進行登記，登記完成后，頒發社會保險登記證。