匯算清繳時間是在納稅年度終結后的5個月之內，即第二年的1月1號到5月31號。例如，2013年的企業所得稅的匯算清繳時間是在2014年的1月1號到5月31號。通常內資企業需要在當月或者是季度終結后的15天之內，向稅務機關提交申報材料。而外資企業則都是在季度終結后的15天之內，向稅務機關提交申報材料的。

匯算清繳的對象是所有財務制度健全、賬目明細清晰、收入憑證和費用憑證齊全的企業，通常這些企業會被稅務機關認定適用征收查賬。在年終時，企業均需要辦理所得稅的匯算清繳。內資和外資企業在年度終結之后的一個半月到四個月之內，向所在地稅務機關提交會計核算表，等待匯算清繳的通知。個人獨資企業和合伙企業同樣需要辦理企業所得稅的匯算清繳，相對來說手續更加簡單。