1、概念不同：項目支出是在基本支出之外的，財政預算專款所安排的支出；

2、所包含的對象不同：基本支出主要是人員經費和日常公用經費這兩個部分；

3、性質不同：基本支出是日常所需要的必要支出，并且他們不容易變動。項目支出是有計劃性的支出，它具有可變性。

項目支出指的是行政單位為了早日實現特殊的工作任務或者事業前進目標，拋開項目基本的預算不說，財政部再單獨安排專項項目所需的預算資金。其中項目支出的預算環節，涵蓋了要把項目支出預算納入全年預算的內容，因此獲得了財政撥款，項目支出的使用環節，主要是資金授權審批、支付的方式以及支付金額。項目完成之后地項目預算，主要涵蓋了剩余資金的管理，項目資金支出的情況分析等。總的來說，項目支出的存在，提高了項目工程的要求，管理也變的更加嚴格規范了。