1、還貸剛開始執行：申請獲批后，公積金就斷供的話，會被認定為騙取福利行為（公積金貸款利率低），會被強制轉成商貸（商貸利率比公積金貸高）。嚴重的話，有些銀行會將貸款人告上法庭，會面臨罰息，房產還會因此受到影響。

2、斷供時間過長：如果斷供時間過長的話（超過半年），公積金管理中心可能會要求重新評估審核，按照公積金貸款的申請條件，中間有斷供會不允許辦理公積金貸款，那么極有可能之前的貸款就轉成商貸了。

公積金補繳辦理：

1、單位經辦人正確填寫《住房公積金匯補繳書》和《住房公積金補繳清冊》并加蓋單位預留財務印鑒；

2、單位經辦人攜帶填好的《住房公積金匯補繳書》和《住房公積金補繳清冊》及支票或現金到辦事處進行補繳登記；

3、登記完成后，中心柜員將加蓋結算印章的《委托收款專用憑證》第二、三聯、《住房公積金匯（補）繳書》單位聯、《住房公積金補繳清冊》單位聯及支票（現金）交由單位經辦人到銀行窗口存款；

4、銀行窗口收妥款項后，在《住房公積金匯（補）繳書》上加蓋銀行收訖印鑒，返單位經辦人作為記賬憑據。