注冊賬戶轉賬和境內匯款的區別如下：

1、轉賬功能不同
注冊賬戶轉賬可以進行注冊賬戶之間的資金劃轉，還可向已注冊的他人賬戶劃轉資金，也可以異地轉賬匯款；境內匯款可以向同城或異地個人以及單位客戶賬戶轉賬匯款。
2、轉賬方式不同
注冊賬戶轉賬可完成活期轉活期、活期轉定期、定期轉活期等多種類型賬戶間的轉賬；境內匯款是指個人客戶通過個人網上銀行、電話銀行、手機銀行、多媒體自助終端等電子銀行渠道，向除注冊賬戶以外的其它工商銀行賬戶，進行本外幣轉賬匯款的業務。
3、方便程度不同
網上銀行為用戶提供24小時全天候服務、正常情況下資金實時到賬，免去在銀行柜面的排隊等候之憂，節約時間。境內轉賬匯款在使用工行轉賬匯款業務時，工行系統將自動判斷所填寫的收款人信息的正確性，避免誤操作的發生。
注冊賬戶轉賬指的是掛在網銀上的賬戶，因為一個身份證在一家銀行只能開通一個網上銀行，但是可以辦理多種銀行卡，將這些銀行卡關聯在這個網銀里，這些銀行卡就是該網銀的注冊賬戶，這些銀行卡之間的轉賬就是注冊賬戶轉賬。